La Société nationale de Médecine et des Sciences médicales de Lyon fut fondée en 1789 sous l'impulsion d'un groupe de médecins lyonnais conduit pat Marc-Antoine Petit (qui devint plus tard chirurgien major du Grand Hôtel Dieu de Lyon).
C'est la plus ancienne société médicale de Lyon, héritière de l'ancien Collège des médecins de Lyon fondé par Symphorien Champier au XVI^e siècle.
Elle a été reconnue d'utilité publique par décret impérial du 27 février 1856 et par décret du 16 mai 1923.
Présidée par le doyen honoraire Neidhardt, la Société nationale de médecine se tourne particulièrement vers l'étude de l'histoire de la médecine et de la chirurgie.
Elle possède de nombreuses collections d'anatomie et, plus largement, d'histoire naturelle médicale, qui sont déposées à l'Université Claude Bernard de Lyon. Celles-ci sont visibles au musée Testut-Latarjet