Friedrich Löffler est un bactériologiste allemand.

Il étudie la médecine à l'Université de Wurtzbourg et au Friedrich-Wilhelm-Institut de Berlin. Il est d'abord collaborateur de Robert Koch à l'Office impérial de santé. Il devient professeur d'hygiène et d'histoire de la médecine à l'Université de Greifswald en 1888, puis à Berlin. Il est chargé de mission par le gouvernement allemand pour contrer l'épidémie de fièvre aphteuse en 1897. Il fonde en 1910 sur l'île de Riems le premier institut de recherche virologique scientifique, rebaptisé en 1952 Friedrich-Loeffler-Institut. Il prend la direction du Robert Koch-Institut en 1913.

Il travaille notamment sur la diphtérie, isolant et cultivant le premier son bacille en 1884. Il énonce dès 1883 les trois conditions nécessaires à l'apparition de cette maladie. Il devine l'existence d'une toxine diffusée dans tous le corps par le bacille. Il découvre par ailleurs les agents de la morve du cheval et du rouget de porc. Il collabore notamment avec Paul Frosch.

Il est élu associé étranger de l'Académie de médecine le 8 novembre 1910.