Mémoires de l'Académie des Sciences, Belles-Lettres et Arts de Lyon, 28 : 247-324.

Anonyme [S. l. n. d.]. Discours prononcé au peuple assemblé dans une des salles de l'Hôtel-de-Ville, le dimanche 20 décembre 1716, à l'occasion de la nomination de MM. J.-B. Goiffon et J. Peisson aux fonctions d'échevins... Bibliothèque municipale de Lyon, Silo ancien. Bange C. 2009. La réception de Linné et le mouvement linnéen à Lyon de 1750 à 1830. Bull. mens. Soc. linn. Lyon, hors-série n°1, 2009 : 41-59. Boucaud-Maitre Yves 2017. Goiffon Georges Claude (1713-1776), p. 608-610. Saint-Pierre Dominique ed. 2017. Dictionnaire des Académiciens de Lyon. 1700-2016. Lyon, Édition de l’Académie, 1369p. Boucaud-Maitre Yves 2019. Jean-Baptiste Goiffon, un médecin des Lumières face à la peste. Imprimerie Fontaine, Ambérieu en Bugey. Gilibert An XII. Notice historique et critique sur la vie et les écrits de J.-B. Goiffon, célèbre médecin de Lyon et auteur de la première Flore lyonnaise. 10 p. Manuscrit. Bibliothèque de la Société d’agriculture de Lyon. Magnin A. 1886. Encore goiffon ! Goiffon botaniste, auteur de la première flore lyonnaise. Lyon-revue : recueil littéraire, historique & archéologique : science et beaux-arts, 7e année, n° 69 & 70 : 156-160. Gallica. Magnin Antoine 1907. Additions et corrections au prodrome des Botanistes lyonnais. Annales de la Société botanique de Lyon, 32, Notes et Mémoires, Comptes-rendus des séances, 3-4e trimestres : 103-141. Goiffon, n° 56, p. 108. Mollière Dr Humbert 1886. Un précurseur lyonnais des théories microbiennes : J.B. Goiffon et la théorie animée de la peste. Mémoires de l'Académie des Sciences, Belles-Lettres et Arts de Lyon, 28 : 247-324. Roux C. 1907. Bibliographie méthodique des principaux manuscrits inédits relatifs à l’histoire naturelle. Annales de la Société d’agriculture sciences et industrie de Lyon, 1er fascicule, 183-288. Goiffon, n° 258, p. 211 ; n°273 et 274, p. 213.

1714. Traité sur les maladies des bestiaux qui régnèrent en France en 1714, avec les remèdes convenables, composé par ordre de Monseigneur le maréchal duc de Villeroy. Lyon, André Laurens.
1721. Observations faites sur la peste qui règne à présent à Marseille et dans la Provence. Lyon, avec avertissement. Lyon, A. Laurens. Contenant Avertissement (non signé), 62 p. Observations sur la maladie contagieuse de Marseille par MM. Bertrand, Jean-Baptiste et Michel médecins aggrégés à Marseille, et un mémoire sur la méthode de M. Michel, médecin et de remèdes dont on dit s’être bien trouvé à Marseille, 29 p. Lettre en réponse à M. P…. docteur en médecine professeur aggrégé au collège des médecins de Lyon (signée G.), 24p.
1722. Relations et dissertation sur la peste du Gévaudan. Lyon, P. Valfray, 188 p. Bibliothèque numérique de Lyon.

Index planturum quae circa Lugdunum nascuntur ; Descriptio montis pilati, 500 p. in 4°, 1700 (ou 1715 ?), par le Dr J.-Bapt. Goiffon (= Botanicaon lugdunense Gilibert ; = Catalogue des plantes du lyonnais et des provinces voisines, in Haller, t. II, p. 615 et auct. post. Muséum de Paris. Roux 1907, n° 274.
Herbier composé en 1669 par René Marmion ou Marion, pharmacien à Valence, en Dauphiné, et portant cette note : « les noms ajoutés (postérieurement) sont de la main de M. Goiffon, médecin de Lyon ». Conservatoire botanique du parc de la Tête-d’Or, à Lyon. Roux 1907, n° 258.
Manuscrits divers, de Goiffon, vendus avec de vieux papiers, après la mort des Gilibert père et fils ! Roux 1907, n° 373.

Herbier conservé au Jardin botanique de Lyon.