Wilhelm PFEFFER est un botaniste prussien.

Il obtient son doctorat à l’université de Göttingen. Élève de Nathanael PRINGSHEIM, il étudie et fait des recherches à Marbourg, Wurtzbourg et Bonn. Il devient professeur de botanique à Tübingen et à Bâle avant de venir enseigner en 1887 à Leipzig où il dirige également le jardin botanique.
Il devient membre de la Royal Society en 1897 et est membre correspondant de l’Académie des sciences de Paris.
PFEFFER étudie les phénomènes d’osmoses et est l’un des premiers à mettre au point des membranes semiperméables. Il étudie également les pressions osmotiques et démontre que la pression nécessaire pour diluer du sucre est proportionnelle à sa concentration. Il expérimente des milieux nutritifs artificiels pour la culture des plantes.