Diplômé de l'École d'Agriculture de Grignon, il a été directeur de la station de pathologique végétale de Cadillac (Gironde). Il découvrit la "greffe Cadillac". En 1918, Joseph Capus obtint le Prix Montaigne, décerné par l'Académie des sciences.
Député Gauche républicaine démocratique de la Gironde de 1919 à 1928., Sénateur de la Gironde de 1930 à 1940. Ministre de l'Agriculture (1924). Il fut le créateur de l'INAO.