Archives départementales du Jura 3 E 4679 (10 décembre 1813), 4681 (3 septembre 1815), 4683 (17 juillet 1817), 4706 (14 mars 1840), 4708 (14 avril 1842), 4714 (26 juin 1848), 4716 (16 novembre et 4 décembre 1850), 4719 (30 septembre 1853), 4861 (28 septembre 1847), 4939 (30 novembre 1845), 4947 (14 juillet 1853), 4949 (28 mars 1855), 5957 (22 mars 1813), 7686 (19 décembre 1871), 7698 (14 septembre 1883), 7700 (9 mai 1885) et 10302 (17 juin 1897). Archives du musée de Lons-le-Saunier . Inventaires : ROBERT (Jules-Zéphirin), Catalogue des dons faits au musée par Monsieur A. Coquet, de Lons-le-Saunier, chef mécanicien de la marine impériale (1855-1879), Lons-le-Saunier, 20 avril 1896, 20 p. ms. . Dossiers des donateurs : André Coquet (1855-1873) Coquillages et crustacés. Regards naturalistes sur la biodiversité, exposition au musée des beaux-arts de Lons-le-Saunier, avril-novembre 2015.

Bulletin des lois. Partie supplémentaire, Paris, 1868, n°1478, p. 394-395.
Bulletin des lois. Partie supplémentaire, Paris, 1886, p. 796.
Jean Eugène Defranoux, « Découvertes et observations faites de 1855 à 1858 inclus, dans l’arrondissement géologique de Lons-le-Saunier (Jura), par plusieurs géologues », Revue d’Alsace (1859), Colmar, 1859, p. 39.
Mémoires de la Société d’émulation du Jura (1882), Lons-le-Saunier, 1883, p. 346.
Travaux de la Société d’émulation du Jura (1863), Lons-le-Saunier, 1864, p. 317.

André Coquet contribue personnellement à l’enrichissement des collections (1855-1873) en donnant au musée de Lons-le-Saunier au moins 29 pièces (histoire naturelle, archéologie antique et ethnologie méditerranéenne contemporaine) et 3 collections (« coquilles » de Ceylan, monnaies d’Asie contemporaines et « insectes scarabées d’Afrique et d’Amérique »). Le 26 octobre 1869, Jules-Zéphirin Robert lui remet un inventaire du tout accompagné de ces mots : « Tu verras, cher ami André, la description des dons que tu as fait à notre musée dans le catalogue que je t’envoie ».