©Académie nationale de médecine

- Anonyme 1827. Liste générale des membres fondateurs de la Société d’horticulture de Paris. Annal. Soc. Horti. Paris, I : 13-36. Bonafous Matthieu, p. 15. - Anonyme 1836. Tableau de la Société Linnéenne de Lyon en 1836. Liste des principaux dons fait à la Société linnéenne de Lyon. Ann. Soc. linn. Lyon, 1836 : 37-53. Bonafous (le docteur Mathieu), p. 40. - D’Hombres-Firmas Louis-Augustin, Notice biographique sur M. Mathieu de Bonafous présentée à l'Académie du Gard le 17 avril 1852, Société d’agriculture de l’Hérault, 1852. - L. Bouchard, Notice biographique sur le chevalier Matthieu de Bonafous, Bouchard Huzard, Société d’horticulture de Paris, 1853. - Paul-Antoine Cap, Mathieu Bonafous, éloge couronné par l'Académie de Lyon, dans sa séance publique du 11 juillet 1854, Académie des Sciences, Belles-lettres et Arts de Lyon, 1854. - Jules Forest, Éloge historique de Matthieu Bonafous, Vingtrinier, Lyon, 1860. - A. Vachet, Nos lyonnais d’hier : 1831-1910. Chez l’auteur, Aux Chartreux, Lyon, 1910, p. 41. - Franqueville, Institut de France, le premier siècle, t.2, n° 436 Numelyo, Bibliothèque numérique de Lyon - Annales de la Société d'émulation des Vosges, 1852 - Académie nationale de médecine. Index biographique des membres, des associés et des correspondants de l’Académie de médecine : 1820-1990. 4e édition. Paris : Académie nationale de médecine, 1991. - Nécrologie dans le Bulletin de la Société d'encouragement pour l'industrie nationale, 1852, page 506.

- 1813, Riflessioni filosofico-morali
- 1821, De l'Éducation des vers à soie, d'après la méthode du comte Dandolo
- 1822, De l'éducation des vers à soie et de la Culture des mûriers
- 1826, Notice sur l’introduction des chèvres du Thibet.
- 1828, Note sur un moyen de préserver les champs de la cuscute.
- 1829, Coup d'œil sur l'agriculture et les instituteurs agricoles de quelques cantons de la Suisse.
- 1833, Mémoire sur la fabrication du fromage du Mont-Cénis.
- 1833, Traité du maïs, ou histoire naturelle et agricole de cette céréale [imprimé par ordre de la Société royale et centrale d’agriculture].
- 1836, Histoire naturelle, agricole et économique du maïs.
- 1840, Traité de l'éducation des vers à soie et de la culture du mûrier, suivi de divers mémoires sur l'art séricicole.

Bibliothèque municipale de Lyon, Donation Bonafous (1859) : 57 manuscrits : Ms 5371 à Ms 5384 bis; Ms 6027 à 6060; Ms 6136; Ms 6172; Ms 6700.