Mathieu Duret est un médecin français.

Issu d'une famille de protestants convertis au catholicisme, il est le fils de Charles-Louis Duret, docteur en médecine et maire d'Annonay et le petit-fils de Charles Duret, consul d'Annonay.

Il commence ses études à Paris puis il obtient son doctorat en médecine à la Faculté de Montpellier. Il exerce pendant plus de cinquante dans sa ville natale d'Annonay, où il est médecin et administrateur de l'hôpital. Il épouse en 1787 Jeanne Catherine de Montgolfier, issue d'une famille de notables locaux. Il devient membre du conseil général de l'Ardèche à la suite du 18 brumaire et le préside à plusieurs reprises. Il est également élu maire d'Annonay en 1815. Disciple de Jenner, il participe à la diffusion de la vaccine de Jenner.

Il est élu adjoint correspondant de l'Académie de médecine pour la section de médecine le 5 avril 1825.

Il résidait au 378 de la rue Grangéat. Une rue d'Annonay porte aujourd'hui son nom.