Rudolph Wagner est un anatomiste et physiologiste allemand.
Il effectue sa formation médicale à l'Université Friedrich-Alexander d'Erlangen-Nuremberg à partir de 1822 puis à Wurtzbourg, où il obtient son doctorat en 1826. Il étudie ensuite une année aux Jardin des plantes à Paris.
Il s'installe pour exercer à Augsbourg puis à Erlangen, où il est nommé prosecteur. Il y est nommé professeur de zoologie et d'anatomie comparée en 1832 et occupe ces postes jusqu'en 1840. Il devient alors professeur d'anatomie à l'Université de Göttingen.
Il est principalement connu comme le co-découvreur de l'ovocyte. Ses travaux notables portent sur les ganglions nerveux sensitifs, les terminaisons nerveuses libres et le système nerveux sympathique.
Il est élu correspondant étranger de l'Académie de médecine le 24 février 1835.