La Commission est créée par arrêté préfectoral du 1er mars 1860, conformément au voeu du Conseil général du 25 avril 1859. Elle se compose de trente membres titulaires nommés par le préfet sur proposition de la commission et d'un nombre illimité de membres correspondants élus par la commission.
Elle est spécialisée dans l'histoire du département de la Charente-Maritime et la protection de ses monuments.

De nouveaux statuts sont élaborés le 29 janvier 1880 et approuvés par le préfet le 31 mars suivant.

Elle fusionne avec la Société d'archéologie de Saintes et prend le nom de Commission des arts et monuments historiques de la Charente-Inférieure et Société d'archéologie de Saintes.